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室内林木器官精细微观表型监测平台

Category: LemnaTec Model: SeedAIxpert
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用途场景

研发 实验室研发、新产品开发、技术研究
生产 生产线检测、工艺控制、制造过程监控
品控 质量检验、来料检测、成品测试
合规认证 计量检测、仪器校准、精度验证
教学实训 教学实验、技能培训、实训演示
维修 设备维修、故障诊断、维护保养

Specifications

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室内林木器官精细微观表型监测平台——SeedAIxpert是国际上植物表型成像系统商业化鼻祖德国LemnaTec公司推出的适用于实验室的植物表型测量设备。本系统可见光成像模块及照明装置位于顶部,可对植物进行表型分析,同时配备叶绿素荧光模块,可测量植物光合活性。SeedAIxpert可对植物器官进行精细测量,可对种子发芽进行表型分析,可对基于滤纸发芽的种子进行表型成像测量,进行形态学研究。适用于植物生理学、农业科学、遗传育种、种子生理学、种子病理学等研究领域。

主要功能

l 对种子等小型样品进行可见光顶部成像

l 通过可见光成像可以测量并分析,可测定种子、叶片、植株、果实等的数量、大小、形状、颜色、颜色分级、质心、圆度、偏心率、叶面积、叶病斑等。叶绿素荧光模块可提供F(I), Fo, Fm, Fm’, F, Fo’, Fv/Fm, Y(II), ETR(Ⅱ), Y(NO), Y(NPQ), NPQ, qN, qP, qL, F/Fm ,Fm’/Fm, P700ox, P700m, P700m’, Y(I), Y(ND)和Y(NA), PQ Poolsize 等参数。

l 可适用湿滤纸种子发芽、小型植物的测量

l 可适用于培养皿内植物组织或病虫害侵蚀实验的测量

主要特点

l 高清摄像头,分辨率达到4112 x 3008,1230万像素

l 背景光源为均匀漫散射LED光源,减少反光现象

l 可测量数据(原始数据以像素为单位):可测定种子、叶片、植株、果实等的数量、大小、形状、颜色、颜色分级、质心、圆度、偏心率、叶面积、叶病斑等。

l P700测量光源:采用双波长测量光源,波段分别为830nm和875nm,用户可根据需求调整测量光强强度,共20个档位可调,实现自动平衡功能。

l 叶绿素荧光测量:能够测量F(I), Fo, Fm, Fm’, F, Fo’, Fv/Fm, Y(II), ETR(Ⅱ), Y(NO), Y(NPQ), NPQ, qN, qP, qL, F/Fm ,Fm’/Fm等参数,以及各种荧光动力学曲线。同时通过脚本编辑,可自定义不同功能的荧光动力学曲线的测量。

l P700测量:能够测量P700ox, P700m, P700m’, Y(I), Y(ND)和Y(NA), PQ Poolsize等参数,以及各种P700动力学曲线,包括P700氧化动力学曲线、P700还原动力学曲线、P700氧化还原动力学曲线等。

l 数据采集与显示:可以连续显示数据采集过程及完整的动力学曲线过程;可以对每一条测量数据进行标记,用于样品间区分,标记信息随数据集同步保存;可以同时显示多个样品的测量曲线,直观对比样品间差异;可对曲线进行多点平均,可对重复样品的多个测量进行曲线平均并导出平均后的曲线。可对曲线进行指定时间点的归一化处理;可以对荧光动力学曲线进行拟合或计算。

l 诱导曲线测量功能:手动或自动,自动模式下有三种运行方式,分别为荧光诱导动力学曲线、荧光诱导动力学曲线+暗弛豫动力学曲线、Trig曲线。手动和自动模式下均可随时更改诱导曲线的光化光强度,自动程序可测量荧光诱导曲线、诱导曲线+暗弛豫,自动重复已完成的手动测量流程。测量过程中能自动分析和记录所有荧光参数的变化趋势。

l 光曲线测量功能:用户可设置的光梯度个数为20个,可随意设置光曲线步数,可测量滞后光曲线,自带拟合方程,可对光曲线进行拟合得到α、ETRmax、Ik等参数。

l 快速诱导动力学曲线功能:可以测量Poly300ms荧光快速上升相,可以测量QA再氧化动力学,实现OJIP等曲线的测量功能。

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测量模式和分析模式选择 双通道模式测量光设置
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同步测量PSI和PSII诱导曲线和暗弛豫 同步测量PSI和PSII光响应曲线
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同时绘制两条Poly_300ms的快相曲线 测量系统间电子传递载体(PQ)库

软件功能

l 控制软件:控制软件是操作人员用来控制测量系统实现硬件测量的软件部分,操作人员可以在控制软件界面上直观地进行各类参数,包括但不限于背景光源、相机曝光、相机白平衡红色增益、相机白平衡蓝色增益设置的调整与设定,从而对硬件模块进行精准控制;用户可将不同硬件设置文件存储为不同的配置文件,可选择不同配置文件组成成像配置文件组合,可在控制软件中输入样品ID、实验名称、选择成像配置文件,完成成像硬件设置

l 分析软件:分析软件是用户用来对采集的表型数据进行分析的软件部分,分析过程采用建立工作流程模式(自带算法),支持多种工作流程满足不同需求。软件具有图形化编程环境提供可自主建立分析过程的操作平台,提供120多个可视化图像分析辅助模块,用户可根据实验需求自由组建分析流程,支持单独或多重流程的保存与应用,可将已设置的流程保存为常用流程模板。分析流程采用模块化设计,用户可通过图形化界面自由组合分析步骤,选择数据路径、命名流程,并根据需求调用指定分析模块,并支持对分析模块的参数进行精细调整,适应不同数据和实验需求。最终结果支持自定义样式输出;

l 实验管理软件:实验管理软件可允许用户对所有实验测量的数据进行归类、查找、批量分析、数据储存、图表绘制等,也可对数据分析结果进行管理,分析结果可按照实验名称批量显示,通过样本 ID 号,成像日期,分析结果等进行筛选。同时,软件可以将结果数据可视化并保存。可以通过自定义设置,在实验管理软件中直接选择折线图、柱状图、散点图等多种可视化形式,直观呈现分析结果。

l 软件系统可追溯所有测量数据,并且可以在软件中制作图表进行对比分析

应用实例

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发芽检测

用SeedAIxpert检测种子萌发出的根,并用黄色标记。提供发芽率(有根/无根的种子与种子总数的关系)。可以测量检测到根的参数,如根的长度。

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包衣种子的萌发检测

SeedAIxpert也被设计用于处理有涂层的种子。根据根的发生情况将包衣种子分为发芽和不发芽两类。由于SeedAIxpert可以进行颜色分析,它可以同时处理不同包覆的种子。

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人工智能种子分类

新生的幼苗由不同的部分组成,如根、嫩枝或根毛。通过机器学习算法,可以训练SeedAIxpert分别识别这些部分。

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玉米发芽

以玉米发芽试验为例,纸顶法。SeedAIxpert对样本进行图像处理,并从图像中获得种子萌发质量数据。

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用机器学习方法对蔬菜种子发芽进行分类

用SeedAIxpert机器学习算法对在纸顶测试中发芽的蔬菜进行分类。对茎和根的发生情况和大小进行分析,并进行后续的质量评定,例如,可以建立可用的植物试验。

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种子分类

玉米种子表面可见胚和胚乳。利用SeedAIxpert软件对种子进行成像和分类,测量每个种子的胚和胚乳的分数。

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幼苗出现测试

以油菜为研究对象,采用基质育苗法测定油菜的萌发率。对出苗子叶进行识别,测定其萌发频率和幼苗质量。


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